Chaque année de modèle du Mercury Mariner est équipé d'un filtre à air de la cabine. Le but du filtre à air de la cabine dans le Mariner est d'empêcher la poussière et les allergènes de pénétrer dans le système de ventilation de la voiture où il pourrait atteindre la cabine passagers. Mercury recommande le remplacement du filtre d'habitacle tous les 10.000 miles, ou tous les 12 mois. Si le Mariner est fréquemment conduit sur des chemins de terre ou dans des conditions de circulation dense, le filtre se salit plus vite. Un filtre à air d'habitacle propre augmente le flux d'air dans le système de conditionnement d'air et maintient l'air dans la zone des passagers propre.