Peu de virus affectent le système d'exploitation Linux. Cependant, vous pouvez toujours passer les virus pour les utilisateurs de Windows. Il ya deux scanners de virus gratuits pour les systèmes d'exploitation Linux qui permettra à la fois de détecter et supprimer les virus. ClamAV est une application open-source disponibles à travers le référentiel de logiciels de la plupart des distributions. Avast est un produit exclusif disponible gratuitement pour un usage domestique. Les deux produits seront scanner les répertoires sur l'ordinateur Linux et peuvent être utilisés pour analyser les lecteurs de Windows attachés.